Identifizierung neuer prognostischer und prädiktiver Immunzellmarker in seltenen Tumoren: Eine integrative Analyse der Dresdner NCT MASTER-Kohorte
Die Charakterisierung der immunologischen Tumor-Mikroumgebung liefert bedeutungsvolle Erkenntnisse in Bezug auf Prognosevorhersagen und Therapiestratifizierung von Tumorpatienten. Für seltene Tumoren jedoch existieren bisher wenige dieser Analysen und Veröffentlichungen beschäftigen sich kaum mit umfassenden molekulargenetischen und immunologischen multi-omics Untersuchungen. Hier setzt das prospektive, multizentrische DKFZ/NCT/DKTK MASTER-Programm an, das mittels Gesamtgenomsequenzierung (inkl. systematischer Keimbahnanalyse), RNA-Sequencing, Methylom- und Proteomanalysen therapeutisch relevante Alterationen bei Patienten mit seltenen Malignomen identifiziert. Im Rahmen des MASTER-Programms erfolgt eine enge Kooperation mit dem Institut für Immunologie (TUD) und dem Institut für Pathologie (UKD), was eine synergetische Zusammenführung immunologischer, pathologischer und molekulargenetischer Datenströme ermöglicht.
Das ausgeschriebene Promotionsprojekt umfasst die Kohorten-übergreifende Betrachtung der immunologischen Tumor-Mikroumgebung mit experimentell-erhobenen multi-omics Datensätzen und klinischer Prognose von ca. 100 MASTER-Patienten. Somit setzt diese translationale Arbeit die Immunarchitektur der seltenen Tumoren erstmals systematisch in einen prognostischen und prädiktiven klinischen Kontext.
Die tiefgreifende Aufarbeitung der klinischen Krankengeschichte und integrativen Korrelation der molekulargenetischen und immunologischen Datensätze beinhaltet folgende Arbeitspakete:
1. Erstellung einer strukturierten Forschungsdatenbank durch
- Systematische Datenakquise
- Rekonstruktion der Therapiesequenzen
- Datenzusammenführung
2. Statistische Evaluation von prognostischen und prädiktiven Biomarkern
- Identifikation von relevanten immunologischen Markern aus den erhobenen Daten
- Prognostische Validierung
- Wirkstoffklassen-spezifische Stratifizierung
3. Umfassende Zusammenführung der immunologischen, molekulargenetischen und klinischen Daten
- Multi-Layer Korrelation
- Erstellung der Dissertationsschrift und Unterstützung bei der Finalisierung eines Manuskripts zur Publikation in einem peer-reviewed Journal.
- Art der Promotion
- Forschungssemester notwendig?
- Finanzierung/Anstellung
- Angeschlossen an ein strukturiertes Promotionsprogramm?
- Zeitplan
- 01.10.26
- Abteilung / Struktureinheit
- ein Dokument mit weiterführenden Informationen
Betreuung
- Erstbetreuung
- weitere Betreuende
Relevante/Repräsentative Publikation mit evtl. Vordaten
Methodik/Aufgaben
- Experimentell
- klinisch
- theoretisch
- statistisch
Bewerbung
- Benötigte Bewerbungsunterlagen